Ce site Web (http://biow.sb-roscoff.fr/ecole_bioinfo/) héberge le matériel didactique de l'école de bioinformatique organisée par l' ITMO Génétique, génomique et bioinformatique d'AVIESAN, à la station biologique de Roscoff 2013.
| Christine Lemaître | Accueil – Informations générales sur le déroulement de l’école | |
| La station biologique de Roscoff | Bernard Kloareg | [slides] |
| Introduction sur le séquençage : technologies disponibles, types de librairies | Thierry Grange | [slides] |
| Claude Thermes | [slides] | |
| Introduction sur les formats de fichiers, traitement des adaptateurs | Olivier Inizan, Alban lermine | [slides]
[formats] |
| Introduction générale à Galaxy | Olivier Inizan, Alban lermine | [slides]
[tutoriel] |
| Read mapping ; logiciels/algorithmes | Matthias Zyntnicki | [slides]
[handouts] |
| Normalisation, expression différentielle, significativité, réplicats | Julie Aubert | [slides] |
| Introduction à une solution Galaxy/cloud | Christophe Blanchet | [slides] |
| Old generation statistics for next generation sequencing | Jacques van Helden | [slides] |
| Obtention d'un compte sur le serveur de Roscoff. | http://abims.sb-roscoff.fr/faq |
| Aide concernant la plateforme ABiMS | support.abims@sb-roscoff.fr |
| Site web de la formation (diapos, liens, tutoriels, ...) | http://biow.sb-roscoff.fr/ecole_bioinfo/ |
| Serveur Galaxy de Roscoff (nécessite l'obtention d'un compte) | http://galaxy4ggb.sb-roscoff.fr |
Les cours auront lieu à l’hôtel de France: Station biologique Place Georges Teissier.
Chaque participant a reçu un courriel (expéditeur: Charlotte Suhon) indiquant son lieu d'hébergement et le code d'accès.